MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H

Total Repeats: 1254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021519	ATGA	2	8	30	37	50 %	25 %	25 %	0 %	513844329
2	NC_021519	CAC	2	6	99	104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844329
3	NC_021519	GCT	2	6	125	130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844329
4	NC_021519	TAA	2	6	194	199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844329
5	NC_021519	AACTT	2	10	244	253	40 %	40 %	0 %	20 %	513844329
6	NC_021519	AAC	2	6	332	337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844329
7	NC_021519	CTG	2	6	370	375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844329
8	NC_021519	ACT	2	6	412	417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844329
9	NC_021519	TCT	2	6	508	513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844329
10	NC_021519	ACTT	2	8	522	529	25 %	50 %	0 %	25 %	513844329
11	NC_021519	AAG	2	6	556	561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844329
12	NC_021519	AAG	2	6	601	606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844329
13	NC_021519	CTG	2	6	657	662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844329
14	NC_021519	TGT	2	6	697	702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844329
15	NC_021519	TGA	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844329
16	NC_021519	GCC	2	6	864	869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513844329
17	NC_021519	AGC	2	6	878	883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844329
18	NC_021519	AACTGA	2	12	886	897	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	513844329
19	NC_021519	CAA	2	6	908	913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844329
20	NC_021519	CCA	2	6	987	992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844329
21	NC_021519	TAA	2	6	1037	1042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844329
22	NC_021519	CAC	2	6	1055	1060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844329
23	NC_021519	CCA	2	6	1061	1066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844329
24	NC_021519	CAT	2	6	1192	1197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844329
25	NC_021519	ATT	2	6	1438	1443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844330
26	NC_021519	TAT	2	6	1531	1536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844330
27	NC_021519	ATA	2	6	1751	1756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844330
28	NC_021519	TAT	2	6	1759	1764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844330
29	NC_021519	GGC	2	6	1768	1773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844330
30	NC_021519	TGA	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844330
31	NC_021519	ATGC	2	8	1882	1889	25 %	25 %	25 %	25 %	513844330
32	NC_021519	TTG	2	6	1898	1903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844330
33	NC_021519	GTT	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844330
34	NC_021519	GAA	2	6	1980	1985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844330
35	NC_021519	CAC	2	6	1997	2002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844330
36	NC_021519	GTG	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844330
37	NC_021519	CAA	2	6	2028	2033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844330
38	NC_021519	GCTTG	2	10	2086	2095	0 %	40 %	40 %	20 %	513844330
39	NC_021519	AAG	2	6	2120	2125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844330
40	NC_021519	AGT	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844330
41	NC_021519	GCTT	2	8	2173	2180	0 %	50 %	25 %	25 %	513844330
42	NC_021519	AGA	2	6	2181	2186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844330
43	NC_021519	GAA	3	9	2247	2255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844330
44	NC_021519	TTA	2	6	2272	2277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844330
45	NC_021519	G	7	7	2287	2293	0 %	0 %	100 %	0 %	513844330
46	NC_021519	AAC	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844331
47	NC_021519	ATT	2	6	2347	2352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844331
48	NC_021519	CAG	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844331
49	NC_021519	AAG	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844331
50	NC_021519	TTCA	2	8	2440	2447	25 %	50 %	0 %	25 %	513844331
51	NC_021519	AATC	2	8	2452	2459	50 %	25 %	0 %	25 %	513844331
52	NC_021519	GTG	2	6	2536	2541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844331
53	NC_021519	TACG	2	8	2589	2596	25 %	25 %	25 %	25 %	513844331
54	NC_021519	TAT	2	6	2613	2618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844331
55	NC_021519	ACC	2	6	2630	2635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844331
56	NC_021519	ACT	2	6	2717	2722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844331
57	NC_021519	TGG	2	6	2739	2744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844331
58	NC_021519	ACA	2	6	2826	2831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844331
59	NC_021519	GAACA	2	10	2848	2857	60 %	0 %	20 %	20 %	513844331
60	NC_021519	GTTT	2	8	2862	2869	0 %	75 %	25 %	0 %	513844331
61	NC_021519	TTA	2	6	2902	2907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844332
62	NC_021519	GGT	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844332
63	NC_021519	ATC	3	9	2960	2968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844332
64	NC_021519	GAA	2	6	3028	3033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844332
65	NC_021519	TGA	2	6	3090	3095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844332
66	NC_021519	CAA	2	6	3103	3108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844332
67	NC_021519	CGC	2	6	3129	3134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513844332
68	NC_021519	CATT	2	8	3173	3180	25 %	50 %	0 %	25 %	513844332
69	NC_021519	ATT	2	6	3190	3195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844332
70	NC_021519	CCA	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844332
71	NC_021519	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844332
72	NC_021519	CAG	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844332
73	NC_021519	CGTT	2	8	3412	3419	0 %	50 %	25 %	25 %	513844332
74	NC_021519	CTA	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844332
75	NC_021519	AAT	2	6	3451	3456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844332
76	NC_021519	AT	3	6	3471	3476	50 %	50 %	0 %	0 %	513844332
77	NC_021519	ACGA	2	8	3571	3578	50 %	0 %	25 %	25 %	513844332
78	NC_021519	ACCT	2	8	3628	3635	25 %	25 %	0 %	50 %	513844332
79	NC_021519	ATG	2	6	3716	3721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844332
80	NC_021519	CGAT	2	8	3758	3765	25 %	25 %	25 %	25 %	513844332
81	NC_021519	GATT	2	8	3837	3844	25 %	50 %	25 %	0 %	513844332
82	NC_021519	TGG	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844332
83	NC_021519	AAT	2	6	3917	3922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844332
84	NC_021519	TTG	2	6	3970	3975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844333
85	NC_021519	A	6	6	4050	4055	100 %	0 %	0 %	0 %	513844333
86	NC_021519	CAG	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844333
87	NC_021519	A	6	6	4205	4210	100 %	0 %	0 %	0 %	513844333
88	NC_021519	AGC	2	6	4223	4228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844333
89	NC_021519	AGA	2	6	4301	4306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844333
90	NC_021519	GAA	2	6	4356	4361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844333
91	NC_021519	GTG	2	6	4375	4380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844333
92	NC_021519	ATT	2	6	4384	4389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844333
93	NC_021519	ATA	2	6	4591	4596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844333
94	NC_021519	GAA	2	6	4631	4636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844333
95	NC_021519	AGT	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844333
96	NC_021519	TGA	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844333
97	NC_021519	A	7	7	4728	4734	100 %	0 %	0 %	0 %	513844333
98	NC_021519	A	6	6	4819	4824	100 %	0 %	0 %	0 %	513844334
99	NC_021519	TTA	2	6	4879	4884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844334
100	NC_021519	CTT	2	6	4920	4925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844334
101	NC_021519	TTA	2	6	4926	4931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844334
102	NC_021519	ATTA	2	8	4949	4956	50 %	50 %	0 %	0 %	513844334
103	NC_021519	T	6	6	4990	4995	0 %	100 %	0 %	0 %	513844334
104	NC_021519	TGT	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844334
105	NC_021519	TAAAA	2	10	5123	5132	80 %	20 %	0 %	0 %	513844334
106	NC_021519	GAT	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844334
107	NC_021519	GTT	2	6	5198	5203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844334
108	NC_021519	ATG	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844335
109	NC_021519	T	6	6	6072	6077	0 %	100 %	0 %	0 %	513844335
110	NC_021519	CTT	2	6	6155	6160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844335
111	NC_021519	GCA	2	6	6242	6247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844335
112	NC_021519	GAT	2	6	6260	6265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844335
113	NC_021519	AATT	2	8	6280	6287	50 %	50 %	0 %	0 %	513844335
114	NC_021519	GGT	2	6	6296	6301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844335
115	NC_021519	CAA	2	6	6318	6323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844335
116	NC_021519	AGTGA	2	10	6369	6378	40 %	20 %	40 %	0 %	513844335
117	NC_021519	ATT	2	6	6498	6503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844335
118	NC_021519	AAC	2	6	6510	6515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844335
119	NC_021519	TTG	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844335
120	NC_021519	A	6	6	6564	6569	100 %	0 %	0 %	0 %	513844335
121	NC_021519	GTTG	2	8	6581	6588	0 %	50 %	50 %	0 %	513844335
122	NC_021519	TCG	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844335
123	NC_021519	ACG	2	6	6658	6663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844335
124	NC_021519	TGA	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844335
125	NC_021519	GAA	2	6	6734	6739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844335
126	NC_021519	TGG	2	6	6758	6763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844335
127	NC_021519	AGG	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513844335
128	NC_021519	ACG	2	6	6878	6883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844336
129	NC_021519	GAT	2	6	6991	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844336
130	NC_021519	AAGG	2	8	7046	7053	50 %	0 %	50 %	0 %	513844336
131	NC_021519	ACG	2	6	7103	7108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844336
132	NC_021519	ATG	2	6	7170	7175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844336
133	NC_021519	ATCC	2	8	7178	7185	25 %	25 %	0 %	50 %	513844336
134	NC_021519	TGA	2	6	7206	7211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844336
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138	NC_021519	TGAC	2	8	7335	7342	25 %	25 %	25 %	25 %	513844336
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142	NC_021519	TCA	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844336
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261	NC_021519	TGA	2	6	14386	14391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844344
262	NC_021519	A	6	6	14396	14401	100 %	0 %	0 %	0 %	513844344
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265	NC_021519	GAT	2	6	14483	14488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844344
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395	NC_021519	TAC	2	6	19448	19453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844348
396	NC_021519	TGA	2	6	19460	19465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844348
397	NC_021519	ATT	2	6	19509	19514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844348
398	NC_021519	GGTT	2	8	19529	19536	0 %	50 %	50 %	0 %	513844348
399	NC_021519	GAA	2	6	19542	19547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844348
400	NC_021519	ATT	2	6	19575	19580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844348
401	NC_021519	GAAGG	2	10	19602	19611	40 %	0 %	60 %	0 %	513844348
402	NC_021519	ATT	2	6	19641	19646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844348
403	NC_021519	GTT	2	6	19685	19690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844348
404	NC_021519	GCT	2	6	19698	19703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844348
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409	NC_021519	TAA	2	6	19895	19900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844348
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420	NC_021519	TA	3	6	20320	20325	50 %	50 %	0 %	0 %	513844348
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430	NC_021519	TGA	2	6	20759	20764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844350
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433	NC_021519	TAT	2	6	20964	20969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844350
434	NC_021519	ACA	2	6	21051	21056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844350
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437	NC_021519	AAG	2	6	21166	21171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844350
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454	NC_021519	TCTT	2	8	22550	22557	0 %	75 %	0 %	25 %	513844352
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473	NC_021519	TTCAGT	2	12	24202	24213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	513844354
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481	NC_021519	AAG	2	6	24586	24591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844354
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489	NC_021519	TTCA	2	8	25062	25069	25 %	50 %	0 %	25 %	513844354
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491	NC_021519	AGC	2	6	25959	25964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844355
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498	NC_021519	CAT	2	6	26274	26279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844355
499	NC_021519	TTAA	2	8	26332	26339	50 %	50 %	0 %	0 %	513844355
500	NC_021519	CGT	2	6	26439	26444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844355

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